Первоначальное название Института «Филиал ЦНИИП градостроительства в г. Фрунзе». 03.01.1992г. Институт реорганизован в «Кыргызский научно-исследовательский и проектный институт по градостроительству» (КНИИП
градостроительства) приказ №1 от 03.01.1992г. Госстроя Кыргызской Республики).

22.01.1993г. Институт переименован в «КыргызНИИпроект» (приказ №4 от 22.01.1993г. Госархстройинспекции Кыргызской Республики).

28.05.1993г. восстановлено первоначальное наименование «Кыргызский научно-исследовательский и проектный институт по градостроительству» (приказ №32-к от 28.05.1993г. КНИИП градостроительства).

24.06.2013г. Институт переименован в «Государственный научно- исследовательский проектный институт градостроительства и сейсмостойкого строительства» (постановление Правительство Кыргызской Республики №372 от 24.06.2013г.).

05.11.2014г. Институт переименован в «Государственный проектный институт градостроительства и архитектуры» (постановление Правительства Кыргызской Республики №385 от 10.07.2014г.).